42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4633 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  100 
 
 
365 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  94.52 
 
 
365 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  80.61 
 
 
361 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  70.17 
 
 
363 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  69.06 
 
 
363 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  69.06 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  70.72 
 
 
363 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  36.9 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  36.61 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  35.54 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  27.51 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  26.55 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  25.4 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  23.56 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  25.24 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  24.1 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  24.4 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  23.6 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  25.39 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  28.35 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  21.97 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  25.44 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  23.75 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  22.02 
 
 
369 aa  59.3  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  25.96 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  26.83 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  24.85 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  26.33 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  25.94 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  24.52 
 
 
366 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  27.21 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  25.84 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  24.51 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  26.92 
 
 
370 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  27.88 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  22.92 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  26.02 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  23.6 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>