60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1994 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  81.84 
 
 
369 aa  634    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  100 
 
 
369 aa  754    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  48.48 
 
 
366 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  50.55 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  44.93 
 
 
367 aa  353  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  48.77 
 
 
365 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  44.11 
 
 
369 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  46.69 
 
 
366 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  45.63 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  44.87 
 
 
361 aa  316  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  45.63 
 
 
362 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  43.6 
 
 
356 aa  298  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  42.94 
 
 
355 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  43.02 
 
 
366 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  41.18 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  39.89 
 
 
367 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  38.86 
 
 
372 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  40.61 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  40.69 
 
 
367 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  40.62 
 
 
362 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  37.33 
 
 
367 aa  232  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  36.34 
 
 
360 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  39.42 
 
 
368 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  36.47 
 
 
374 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  37.5 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  36.09 
 
 
360 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  32.79 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  37.95 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  33.42 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  28.95 
 
 
369 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  32.76 
 
 
390 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  31.99 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  32.24 
 
 
369 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  29.08 
 
 
371 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  27.7 
 
 
370 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  29.1 
 
 
357 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  28.23 
 
 
983 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  27.98 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  24.66 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  27.82 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  26.75 
 
 
999 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
994 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  27.24 
 
 
360 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  26.74 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  26.75 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  25.66 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.73 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  24.63 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  24.71 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  24.71 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  23.4 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  31.28 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  29.17 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  23.7 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  23.56 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  23.51 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  23.45 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.82 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  24.58 
 
 
355 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>