41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2260 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  58.58 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  58.5 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  27.76 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  29.17 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  26.14 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  28.16 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  26.47 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  28.53 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  25.07 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  27.54 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  25.19 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  26.7 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  25.91 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  23.78 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  26.89 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  27.35 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  24.02 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  26.2 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  24.91 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  24.1 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  32.32 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  24.78 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  24.94 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  21.74 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  24.47 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  25.89 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  26.79 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  23.6 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  22.26 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  24.76 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  30.95 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  24.1 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  25.82 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  24.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  27.24 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  25.31 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>