60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0428 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  63.71 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  54.94 
 
 
367 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  58.72 
 
 
355 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  49.86 
 
 
366 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  56.66 
 
 
362 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  48.06 
 
 
367 aa  366  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  59.75 
 
 
362 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  52.97 
 
 
365 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  51.45 
 
 
361 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  47.35 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  51.57 
 
 
366 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  50.32 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  45.63 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  45.35 
 
 
369 aa  308  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  45.66 
 
 
367 aa  285  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  43.23 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  44.38 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  45.28 
 
 
362 aa  271  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  47.56 
 
 
367 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  39.44 
 
 
360 aa  258  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  45.61 
 
 
368 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  38.4 
 
 
374 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  42.49 
 
 
360 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  43.79 
 
 
375 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  41.88 
 
 
367 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  38.89 
 
 
374 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  37.89 
 
 
381 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  36.18 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  42.7 
 
 
381 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  36.09 
 
 
348 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  32.07 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  37.25 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  29.75 
 
 
371 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  34.4 
 
 
357 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  35.57 
 
 
390 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  29.63 
 
 
369 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  31.54 
 
 
983 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 
994 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  33.99 
 
 
370 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  33.16 
 
 
999 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  29.33 
 
 
372 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  30.28 
 
 
373 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  32.23 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  31.6 
 
 
344 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  25.16 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  30.62 
 
 
363 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  32.44 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  28.1 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  32.47 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  24.48 
 
 
427 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  25.81 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  25.27 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  25.27 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.4 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  25.22 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  27.51 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  24.36 
 
 
365 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  30.61 
 
 
405 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  24.78 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>