58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1850 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  754    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  67.61 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  42.82 
 
 
367 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  44.05 
 
 
367 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  42.9 
 
 
366 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  43.23 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  42.86 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  43.85 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  40.97 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  38.86 
 
 
369 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  41.29 
 
 
365 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  42.31 
 
 
367 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  38.59 
 
 
369 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  38.55 
 
 
374 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  38.67 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  43.59 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  41.14 
 
 
355 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  41.83 
 
 
356 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  39.18 
 
 
381 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  39.16 
 
 
361 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  38.81 
 
 
366 aa  229  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  37.85 
 
 
325 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  37.87 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  39.27 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  36.05 
 
 
367 aa  212  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  40 
 
 
375 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  38.3 
 
 
362 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  34.53 
 
 
360 aa  196  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  34.56 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  32.6 
 
 
369 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  33.13 
 
 
371 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  32.89 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  32.58 
 
 
369 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  32.58 
 
 
370 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  28.85 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  31.76 
 
 
390 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  31.67 
 
 
357 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  30.03 
 
 
999 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  28.01 
 
 
373 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  34.96 
 
 
381 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  29.58 
 
 
983 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  31.42 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  30.4 
 
 
358 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  28.08 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
994 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.64 
 
 
344 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  25.41 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.41 
 
 
354 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  26.9 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  26.92 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  24.92 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  28.19 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  25.4 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  25.75 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  25.85 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  24.66 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.69 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  25.11 
 
 
405 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>