58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2417 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  42.05 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  40.97 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  39.43 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  43.66 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  42.86 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  41.08 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  41.88 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  40.11 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  44.51 
 
 		 355 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  37.33 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  39.48 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  35.93 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  38.87 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  38.66 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  38.35 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  40.56 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  43.45 
 
 		 362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  37.22 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  34.44 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  34.64 
 
 		 374 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  37.84 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  33.52 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  37.12 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  36.67 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  34.73 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  34.59 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  34.55 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  37.04 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  30.47 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  32.8 
 
 		 999 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  30.58 
 
 		 983 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  32.75 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  40.41 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 994 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  33.52 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  33.62 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  29.52 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  32.77 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  27.65 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  27.27 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  26.48 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  28.79 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.86 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  25.62 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  26.13 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  28.1 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  23.49 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  26.05 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  27.07 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  28 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  27.55 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  28 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  24.48 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  26.36 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>