62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3369 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  42.77 
 
 
356 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  43.82 
 
 
375 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  33.73 
 
 
367 aa  195  9e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  32.76 
 
 
369 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  35.33 
 
 
361 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  33.83 
 
 
366 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  35.44 
 
 
366 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  37.03 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  35.57 
 
 
362 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  33.23 
 
 
367 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  33.93 
 
 
369 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  34.81 
 
 
365 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  35.13 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  35.19 
 
 
366 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  32.7 
 
 
325 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  36.55 
 
 
357 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  31.01 
 
 
367 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  32.57 
 
 
362 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  31.9 
 
 
372 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  38.16 
 
 
362 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  32.53 
 
 
360 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  32.39 
 
 
374 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  31.14 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  31.4 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  33.02 
 
 
367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  27.83 
 
 
360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  30.12 
 
 
374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  33.11 
 
 
368 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  29.33 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  33.8 
 
 
354 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  41.22 
 
 
381 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  32.94 
 
 
358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  29.88 
 
 
344 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 
994 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  30.88 
 
 
370 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  27.37 
 
 
348 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  26.36 
 
 
999 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  25.08 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  24.41 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  24.06 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  23.48 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.75 
 
 
983 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  24.07 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  32.6 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.35 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.89 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  29.55 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  24.79 
 
 
427 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  27.88 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.79 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  32.41 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  30.97 
 
 
405 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  27.88 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  26.88 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.7 
 
 
2272 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  28.21 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  28.02 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  25.45 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  28.21 
 
 
363 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>