44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5611 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  84.2 
 
 
405 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  58.5 
 
 
409 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  26.53 
 
 
427 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  26.84 
 
 
367 aa  86.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  30.1 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  33.2 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  28.19 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  28.32 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  25.12 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  24.43 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  25.54 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  25.07 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  23.71 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  27.55 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  28.45 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  25.45 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  23.55 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  28.9 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  28.47 
 
 
325 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  24.67 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  25.28 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  28.83 
 
 
362 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  24.08 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  27.06 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  23.17 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  26.03 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  25.74 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  25.21 
 
 
369 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  25.09 
 
 
361 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  25 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  30.97 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  29.96 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  29.1 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  23.49 
 
 
366 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  27.51 
 
 
362 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  27.27 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  21.43 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  23.77 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  24.54 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  22.77 
 
 
983 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  23.19 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  28.21 
 
 
381 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>