47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4042 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  37.66 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  32.38 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  31.18 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  31.6 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  30.99 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  30.34 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  30.74 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  30.25 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  33.98 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  32.3 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  32.46 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  30.69 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  28.39 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  27.13 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  27.36 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  27.36 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  27.64 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  26.73 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  26.58 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  27.42 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  24.45 
 
 		 367 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  29.14 
 
 		 369 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  28.16 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  30.82 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  31.09 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  27.41 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  30.54 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  23.66 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  27.27 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  24.92 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  24.62 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  25.62 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  25.33 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  30.52 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  22.4 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  23.4 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  23.02 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  31.14 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  30.79 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  24.19 
 
 		 999 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  23.62 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 994 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  22.22 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  24.24 
 
 		 983 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>