60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4084 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  62.43 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  43.5 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  39.3 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  40.85 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  38.59 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  42.62 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  39.18 
 
 		 372 aa  239  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  43.3 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  38.66 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  37.89 
 
 		 362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  38.24 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  32.79 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  36.11 
 
 		 367 aa  219  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  37.98 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  37.92 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  36.9 
 
 		 361 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  40.28 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  37.72 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  35.85 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  34.44 
 
 		 367 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  35.96 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  36.21 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  34.78 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  39.31 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  29.86 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  36.81 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  30.48 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  31.55 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  29.78 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  28.75 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  27.44 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  28.2 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 		 994 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  33.33 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  29.45 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  28.17 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  27.45 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  30.24 
 
 		 999 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  30.92 
 
 		 358 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  28.01 
 
 		 983 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  26.58 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.41 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  28.19 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  26.11 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  27.3 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  27.3 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  26.55 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  24.58 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  25.42 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  26.2 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  28.21 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  22.55 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  25.35 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  22.57 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  23.08 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>