43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3516 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  70.91 
 
 		 365 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  70.72 
 
 		 365 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  70.08 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  61.33 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  60.22 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  60.22 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  36.01 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  35.93 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  36.54 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  28.11 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  26.19 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  27.59 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  28.74 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  26.59 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  29.13 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  26.21 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  26.73 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  25.45 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  26.52 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  24.02 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  22.89 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  27.43 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  23.33 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  21.69 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  29.55 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  24.17 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  25.67 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  24.92 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  26.87 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  21.83 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  24.48 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  29.71 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  22.19 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  26.95 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  23.4 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  27.68 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  28.96 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  22.94 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  26.91 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>