52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2548 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  36.07 
 
 
361 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  35.54 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  35.54 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  35.81 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  31.89 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  35.54 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  35.54 
 
 
365 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  36.54 
 
 
363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  32.74 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  32.7 
 
 
355 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  26.46 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  27.15 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  25.38 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  28.66 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  29.45 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  31.54 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  28.89 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  27.01 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  29.11 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  29.31 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  28.32 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  26.43 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  30.26 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  24.51 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  28.49 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  26.43 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  23.12 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  26.05 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  25.92 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  25.42 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  25.82 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  26.76 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  26.14 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  26.49 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  27.3 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  25.66 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  26.5 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 
994 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  23.9 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  22.7 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  26.79 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  24.4 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  26.43 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  25.08 
 
 
369 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  23.33 
 
 
983 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  25.66 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  27.72 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  21.5 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  28.77 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  25.07 
 
 
999 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>