44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2183 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  100 
 
 
376 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  93.94 
 
 
363 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  69.81 
 
 
365 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  69.06 
 
 
365 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  66.2 
 
 
361 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  60.22 
 
 
363 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  36.42 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  36.9 
 
 
363 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  35.54 
 
 
355 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  26.9 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  26.82 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  27.3 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  27.14 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  25.81 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  27.51 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  27.87 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  24.71 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  26.17 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  25.23 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  24.64 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  24.78 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  27.06 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  29.21 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  25.29 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  22.65 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  27.74 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  23.64 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  27.5 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  25.27 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  22.18 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  27.99 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  26.71 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  25.22 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  27.6 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  25.66 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  28 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  29.53 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  22.79 
 
 
994 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  21.09 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  23.7 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  28.02 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>