60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0429 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  70.44 
 
 
368 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  52.35 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  47.28 
 
 
367 aa  330  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  47.35 
 
 
367 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  48.25 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  48.07 
 
 
360 aa  306  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  45.71 
 
 
369 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  48.63 
 
 
365 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  49 
 
 
366 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  46.72 
 
 
361 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  47.56 
 
 
362 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  48.25 
 
 
362 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  42.02 
 
 
369 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  47.61 
 
 
355 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  47.04 
 
 
362 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  40.69 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  42.82 
 
 
372 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  42.62 
 
 
381 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  41.34 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  43.25 
 
 
374 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  43.68 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  43.98 
 
 
325 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  48.56 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  40.56 
 
 
367 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  38.89 
 
 
367 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  36.89 
 
 
371 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  39.89 
 
 
356 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  42.18 
 
 
375 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  31.9 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  34.4 
 
 
371 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  32.82 
 
 
983 aa  172  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  35.75 
 
 
354 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  40.27 
 
 
381 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  30.11 
 
 
369 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  30.73 
 
 
373 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  35.96 
 
 
358 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  34.86 
 
 
348 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  35.41 
 
 
357 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  31.04 
 
 
999 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  33.9 
 
 
390 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 
994 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  30.53 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  33.98 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  27.87 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  28.53 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  26.84 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  25.98 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  29.75 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  30.97 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  28.32 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  25.5 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  25.33 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  26.89 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  25.33 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  24.19 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  25.37 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  26.73 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  24.25 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>