51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2075 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  100 
 
 
405 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  84.2 
 
 
405 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  58.58 
 
 
409 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  27.13 
 
 
427 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  27.85 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  31.21 
 
 
368 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  29.75 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  29.24 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  26.34 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  27.55 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  24.15 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  28.76 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  28.14 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  30.71 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  28.37 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  28.31 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  23.94 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  25.07 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  26.47 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  28.24 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  25.08 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  25.09 
 
 
367 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  26.17 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  24.19 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  23.75 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  25.55 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  23.96 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  22.81 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  26.12 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  25.87 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  23.46 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  24.04 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  24.64 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  29.34 
 
 
358 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  32.41 
 
 
390 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  26.84 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  23.23 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  23.64 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  27.82 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  24.13 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  29.13 
 
 
362 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  25.93 
 
 
355 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  29.31 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  26.61 
 
 
363 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  26.94 
 
 
355 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  27.54 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  27.54 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  24.62 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  24.76 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  24.37 
 
 
365 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  24.08 
 
 
983 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>