More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1025 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1025  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 305 aa  607  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  37.19 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  34.84 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  36.66 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.2 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  34.81 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  34.47 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.32 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  35.57 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  34.47 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  31.8 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  34.13 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  34.13 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  32.3 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  34.13 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  34.13 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  32.55 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  35.87 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  32.7 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  29.68 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  31.31 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  31.92 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  30.59 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  33 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  32.32 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  34.12 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  30.63 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  32.4 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  31.74 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  31.74 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  34.69 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  31.79 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  28.39 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  32.36 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  31.31 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  31.77 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  34.59 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.06 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  32.03 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  33.89 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  30.82 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  30.13 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  31.74 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  31.91 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>