More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0761 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
475 aa  950    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000018791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  24.91 
 
 
387 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  28 
 
 
1074 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.19 
 
 
830 aa  73.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
975 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  25.36 
 
 
591 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
783 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  26.22 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
713 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  24.45 
 
 
646 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  28.31 
 
 
1323 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
877 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1297 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  28.87 
 
 
1093 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.24 
 
 
1361 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  25.94 
 
 
629 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
653 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  30.04 
 
 
859 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
889 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2035  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.24 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000576701  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
1323 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  22.82 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
974 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
928 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
985 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  28.38 
 
 
957 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
605 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 
731 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  27.01 
 
 
265 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
945 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
803 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  29.72 
 
 
755 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  29.25 
 
 
519 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2387  sporulation kinase B  24.49 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  25 
 
 
1071 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1331 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
601 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  26.12 
 
 
779 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
720 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  25 
 
 
1071 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 
1167 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
902 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  26.61 
 
 
1122 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.45 
 
 
355 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  24.09 
 
 
467 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  24.5 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
601 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
733 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  25.32 
 
 
1128 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  24.89 
 
 
982 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
514 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
572 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  27.34 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
691 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
1169 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1140 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
431 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
562 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  24.45 
 
 
1140 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1140 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
736 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  25.28 
 
 
746 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.54 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  26.34 
 
 
528 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  24.05 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  24.9 
 
 
464 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
503 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1128 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  25.31 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  23.64 
 
 
598 aa  64.7  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  25.6 
 
 
1169 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2655  histidine kinase  23.85 
 
 
433 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.306578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  31.88 
 
 
370 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
785 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  23.77 
 
 
445 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
419 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
484 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
614 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.39 
 
 
563 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
1084 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 
1120 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1170 aa  63.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
463 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  26.91 
 
 
1147 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>