242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1267 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  55.56 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  54.03 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  54.03 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  52.03 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  47.81 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  43.71 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  42.19 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  43.79 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  42.9 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  43.52 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  44.37 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  42.77 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  44.55 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  43 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  42.16 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  41.2 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  42.67 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  43 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  41.83 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  41.97 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  41.91 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  42.86 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  42.43 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  41.91 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  42.38 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  42.38 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  43.23 
 
 		 291 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  44.48 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  40.94 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  41.1 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  40.53 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  38 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  40.2 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  38.16 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  37.46 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  37.75 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  38.49 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  41.31 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  36.24 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  38.49 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37.09 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  36.84 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  38.16 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  38.33 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.67 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  37.12 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.07 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  37.21 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  39.22 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37.5 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.91 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  37.21 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  37.42 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  37.67 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.09 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.09 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  39.87 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  35.76 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.7 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  36.96 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  37.38 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.72 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  40.4 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  37.79 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  40.4 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.3 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  37.12 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  40.13 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  35.1 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.21 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  37.7 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  38.69 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  40.53 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  34.44 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  36.39 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  36.12 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  36.72 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  38.21 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>