242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0989 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  100 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  60.2 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  54.42 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  50.34 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  48.49 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  49.15 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  48.49 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  50.85 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  52.36 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  51.36 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  51.02 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  51.68 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  48.97 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  48.47 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  51.34 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  48.47 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  48.14 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  46.18 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  46.51 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  46.18 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  46.46 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  46.1 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  43.58 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  45.42 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  46.28 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  45.51 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  42.57 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  42.62 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  42.62 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  41.31 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  42.05 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  40.92 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  37.37 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  36.91 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  39.13 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  35.37 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.05 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.46 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  36.6 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.03 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  38.46 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.91 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  36.36 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  35.43 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.54 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  39.06 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  40.13 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  35.91 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  35.02 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  38.08 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  35.02 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.89 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  39.8 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  33.79 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  38.72 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  34.67 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  34.34 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  37 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.11 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  33.11 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  34.46 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  37.58 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  32.43 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  36.54 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  34.46 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.54 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  34 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.79 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  40.07 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  38.57 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  34.11 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  32.67 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  32.89 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>