242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1534 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  66.55 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  65.88 
 
 		 295 aa  362  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  65.54 
 
 		 295 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  51.67 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  51.67 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  51.33 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  48.65 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  48.31 
 
 		 295 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  49.32 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  53.18 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  48.99 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  48.98 
 
 		 310 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  48.31 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  46.96 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  49.32 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  47.99 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  45.95 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  46 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  43.54 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  45.03 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  45.79 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  42.37 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  43.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  42.03 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  44.9 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  43.85 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  41.22 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  46.46 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  39.8 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  44.19 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  44.19 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  41.25 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  43.14 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  42.33 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  38.28 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  38.28 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  37.95 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  37.95 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37.95 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  38.28 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  35.93 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  37 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  37.95 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  34 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  34.58 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  39.47 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.96 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  34.11 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  34.11 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  37.16 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  33.67 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  36.3 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  38.96 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  32.78 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  39.67 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  37 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  32.65 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  32.08 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  33.55 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  36.03 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  36.3 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  32.9 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  33.86 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  32.13 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  32.54 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  35.25 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  31.53 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  38.33 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  38.33 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  37.09 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  34.56 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  30.07 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33.44 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  31.63 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  36.33 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  36.33 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  32.89 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  33.76 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  31.99 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  32.89 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  32.24 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  34.43 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  36.27 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.15 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.63 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  35.93 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  31.63 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  30.59 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  38.99 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>