242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2782 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  85.91 
 
 		 291 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  68.17 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  66.67 
 
 		 294 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  65.98 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  65.64 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  53.74 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  48.31 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  54.42 
 
 		 294 aa  271  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  53.04 
 
 		 295 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  47.3 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  47.46 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  47 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  46.33 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  50.67 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  47.83 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  47.49 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  50.51 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  45.15 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  46.96 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  45.95 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  46.44 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  47.84 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  48.14 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  46.74 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  47.16 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  46.1 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  47.68 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  42.67 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  45.82 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  45.42 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  43.33 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  38.05 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.52 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.73 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  38.67 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.86 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  36.18 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  38.21 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  37.83 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  37.21 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  35.84 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  35.84 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.97 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  35.03 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  35.02 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  36.55 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  36.7 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  36.55 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  38.1 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.8 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.08 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  36.91 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  38.33 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  40.4 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.27 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.58 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.58 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  40.4 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  42.21 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  41.22 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  37.92 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  41.18 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  39.33 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.78 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40.79 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  39.6 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  37.67 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  37.63 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  36.73 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  38.38 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  35.93 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.97 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  38.05 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33.79 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  38.64 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.14 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  37.71 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>