242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1528 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  47.28 
 
 
294 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  49.15 
 
 
296 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  49.15 
 
 
296 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  49.49 
 
 
296 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  47.81 
 
 
298 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  42.28 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  43.29 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  42.81 
 
 
295 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  40.59 
 
 
299 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  42.33 
 
 
296 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  39.53 
 
 
299 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  40.73 
 
 
294 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  39.2 
 
 
299 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  42.28 
 
 
287 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  42.28 
 
 
287 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  39.33 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  39.33 
 
 
287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  39.33 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  39.33 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  37.92 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  38.78 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.29 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  40.2 
 
 
309 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  43.23 
 
 
295 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  41.89 
 
 
289 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  38.33 
 
 
287 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  38.82 
 
 
287 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  42.14 
 
 
291 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  39 
 
 
287 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  38.46 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  37.25 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  38.51 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  38.51 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  36.58 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  40 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  38.51 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  38.51 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  38.98 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  36.07 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40.6 
 
 
287 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.88 
 
 
288 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  36.88 
 
 
288 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  42.9 
 
 
295 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  37.58 
 
 
304 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  38.61 
 
 
287 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  41.81 
 
 
291 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  41.72 
 
 
295 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  38.46 
 
 
304 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  37.04 
 
 
295 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  41.14 
 
 
293 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  41.72 
 
 
293 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  35.69 
 
 
295 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  40 
 
 
304 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  35 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  39.27 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.23 
 
 
288 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  38.8 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  38.1 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  35.53 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  37.25 
 
 
295 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  37.07 
 
 
287 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.82 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  36.45 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  35.2 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35.67 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  37.71 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  35.06 
 
 
287 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  35.97 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  36.24 
 
 
295 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  38.64 
 
 
287 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  37.46 
 
 
288 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  35 
 
 
287 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  39.2 
 
 
287 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  37.46 
 
 
300 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  40.33 
 
 
287 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  37.79 
 
 
300 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  35 
 
 
287 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  39.46 
 
 
294 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>