242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1999 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  584  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  99.34 
 
 		 304 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  87.97 
 
 		 294 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  73.45 
 
 		 304 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  65.98 
 
 		 291 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  64.83 
 
 		 291 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  49.83 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  46.31 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  51.68 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  45.73 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  48.3 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  42.86 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  47.6 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  43.54 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  44.78 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  44.78 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  44.44 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  45.76 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  43.2 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  42.66 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  45.82 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  46.42 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  46.28 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  42.37 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  45.12 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  46.92 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  44.9 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  44.71 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  42.33 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  45.85 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  43.15 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  42.57 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  42.57 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  37.58 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.67 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  34.23 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  37.58 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  35.25 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  36.49 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.15 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  39.59 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  35.02 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.49 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  34.56 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  32.89 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  36.67 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.37 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.18 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  36.03 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  38.13 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  34.35 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  36.48 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.49 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  37.37 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  34.24 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  38.44 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  38.44 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  36.89 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  30.95 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  32.99 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  36.91 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  34.01 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  37.16 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  32.65 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  34.55 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  38.8 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  34.01 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.54 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  32.31 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  30.41 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  37.67 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  32.31 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  35.43 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  33.55 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  33.22 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  32.89 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  37.12 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  37.11 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  35.76 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  31.21 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  33.56 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  34.9 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  32.23 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.89 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  31.89 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>