242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3135 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  51.54 
 
 		 295 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  50.85 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  53.58 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  52.56 
 
 		 295 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  51.88 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  48.46 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  52.56 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  49.16 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  52.72 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  49.83 
 
 		 299 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  48.98 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  52.4 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  52.04 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  52.4 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  49.66 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  48.81 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  48.97 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  48.81 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  46.76 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  48.97 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  47.6 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  47.6 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  48 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  45.24 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  48.29 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  45.24 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  45.27 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  47.16 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  47.16 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  43.29 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  45.76 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  41.78 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  43.96 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  43.14 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  43.14 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  41.78 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  40.07 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  41.1 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  41.1 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  41.1 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  39.06 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.04 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  36.7 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  37.58 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.04 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.04 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.04 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.7 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  36.7 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  38.26 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.92 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.7 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  36.95 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.71 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  37.87 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  40.68 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  40.68 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  40.82 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.03 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  36.95 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  40.86 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  40.34 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  36.03 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.86 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  35.81 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  37.87 
 
 		 287 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  38.05 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  37.7 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  39.33 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  37.63 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  36.7 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  39.38 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  31.97 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  39.46 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.8 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  39.46 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  35.55 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  39.52 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  35.81 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  36.54 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  37.8 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  37.8 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  36.3 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  36.21 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  30.95 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  38.82 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  35.64 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  31.42 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>