242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2522 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  51.55 
 
 
293 aa  266  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  45.95 
 
 
295 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  42.57 
 
 
295 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  42.23 
 
 
295 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  45.7 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  45.3 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  42.37 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  42.18 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  44.07 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  41.36 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  46.1 
 
 
291 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  45.24 
 
 
310 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  42.19 
 
 
299 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  42.86 
 
 
299 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  42.03 
 
 
295 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  42.52 
 
 
299 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  42.42 
 
 
295 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  44.9 
 
 
291 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  46.03 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  44.41 
 
 
295 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  41.69 
 
 
295 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  39.8 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  40.54 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  42.47 
 
 
294 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  44.07 
 
 
295 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  43 
 
 
304 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  43.15 
 
 
304 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  42.19 
 
 
294 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  42.57 
 
 
294 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  43.33 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  43.33 
 
 
296 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  43.67 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  41.14 
 
 
294 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  37.25 
 
 
298 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.27 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.91 
 
 
287 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  36.91 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  36.58 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  35.02 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  39.13 
 
 
287 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.24 
 
 
287 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  38.8 
 
 
287 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  34.97 
 
 
287 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  35.35 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  35.35 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  35.35 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.91 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  35.35 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  35.35 
 
 
287 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38 
 
 
287 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  37.16 
 
 
287 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  38.67 
 
 
287 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  35.22 
 
 
287 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.88 
 
 
288 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  36.54 
 
 
287 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35 
 
 
287 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  35.22 
 
 
288 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  35.23 
 
 
287 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.33 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  31.1 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  34.56 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  37.29 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  34.56 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  34.56 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.21 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  34.45 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  31.44 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  32.67 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  37.33 
 
 
287 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  34.33 
 
 
287 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  34.33 
 
 
287 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  35.95 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  32.11 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33.12 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  31.77 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  36.67 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  35.23 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  36.7 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  35.15 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  35.23 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  35.1 
 
 
287 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  35.22 
 
 
287 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  35.1 
 
 
287 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  35.1 
 
 
287 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  35.1 
 
 
287 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  35.1 
 
 
287 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  37 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  37 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  33.67 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  35.47 
 
 
288 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  34.77 
 
 
287 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  36.67 
 
 
288 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  34.67 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>