242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2239 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  80.82 
 
 
292 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  63.01 
 
 
292 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  55.63 
 
 
293 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  57.77 
 
 
291 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  57 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  56.31 
 
 
292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  46.92 
 
 
292 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  43.24 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  43.24 
 
 
291 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  42.57 
 
 
294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  43.92 
 
 
291 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  42.91 
 
 
291 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  46.58 
 
 
291 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  42.57 
 
 
291 aa  234  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  45.89 
 
 
291 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  39.8 
 
 
294 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  39.46 
 
 
294 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  42.18 
 
 
292 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  46.58 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  45.55 
 
 
291 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  41.98 
 
 
293 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  43.15 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  42.57 
 
 
291 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  42.32 
 
 
293 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  44.37 
 
 
292 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  38.7 
 
 
292 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  42.12 
 
 
292 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  44.26 
 
 
291 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  39.12 
 
 
292 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  38.36 
 
 
292 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  37.2 
 
 
293 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  40.83 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  41.81 
 
 
293 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  40.41 
 
 
288 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  38.1 
 
 
294 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  37.88 
 
 
290 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  39.32 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  33.79 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  37.12 
 
 
293 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  35 
 
 
293 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  38.78 
 
 
287 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  36.86 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  37.76 
 
 
287 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  38.49 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  36.05 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  39.19 
 
 
295 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  37.37 
 
 
295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  37.67 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  37.99 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  36.15 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  38.85 
 
 
287 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  37.41 
 
 
287 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.39 
 
 
287 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.39 
 
 
287 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.33 
 
 
287 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  33.68 
 
 
287 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  36.05 
 
 
287 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  39.04 
 
 
292 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  36.3 
 
 
288 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37.87 
 
 
287 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  35.93 
 
 
288 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  37.38 
 
 
295 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  35.91 
 
 
293 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  36.27 
 
 
288 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  38.51 
 
 
287 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  37.25 
 
 
288 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.88 
 
 
287 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.54 
 
 
287 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  35.79 
 
 
291 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.3 
 
 
309 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.99 
 
 
287 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  38.03 
 
 
300 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  32.67 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  36.27 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  38.49 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  34.13 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  36.95 
 
 
290 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  33.67 
 
 
297 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  36.05 
 
 
287 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  36.05 
 
 
287 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  36.82 
 
 
287 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  38.96 
 
 
296 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  36.82 
 
 
287 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>