242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0463 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  99.67 
 
 
299 aa  593  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  84.62 
 
 
299 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  57.19 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  53.18 
 
 
295 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  54.85 
 
 
295 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  54.85 
 
 
295 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  51.67 
 
 
296 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  48.83 
 
 
295 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  49.83 
 
 
295 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  51.84 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  50.17 
 
 
310 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  48.16 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  49.16 
 
 
295 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  49.83 
 
 
295 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  52 
 
 
295 aa  261  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  48.83 
 
 
294 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  47.83 
 
 
291 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  49.5 
 
 
295 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  47.83 
 
 
291 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  46.46 
 
 
304 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  47.33 
 
 
295 aa  245  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  48.36 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  49.83 
 
 
293 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  44.63 
 
 
304 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  43.77 
 
 
294 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  44.78 
 
 
304 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  46.67 
 
 
294 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  46.69 
 
 
296 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  46.69 
 
 
296 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  46.51 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  45.21 
 
 
296 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  41.83 
 
 
298 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  37.33 
 
 
287 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  37.67 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.67 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  39.53 
 
 
294 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.67 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  36 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  37.58 
 
 
309 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  33.77 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.56 
 
 
287 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.44 
 
 
288 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  37.54 
 
 
287 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.75 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  37.54 
 
 
287 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  34.78 
 
 
295 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  32.89 
 
 
287 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  35.88 
 
 
287 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  34.67 
 
 
288 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  34.75 
 
 
287 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  33.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  35.33 
 
 
288 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  32.78 
 
 
288 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  35 
 
 
291 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  36.89 
 
 
287 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  35.55 
 
 
287 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  34.33 
 
 
288 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  35.22 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  37.05 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  37.05 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  35.97 
 
 
287 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  34.33 
 
 
293 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  35.29 
 
 
287 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  34.22 
 
 
294 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  35.22 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  34.22 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  36 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  36 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  37.79 
 
 
287 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  32.78 
 
 
287 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  34.56 
 
 
287 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  35.53 
 
 
287 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  31.88 
 
 
287 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  34.33 
 
 
288 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  30.87 
 
 
287 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  30.87 
 
 
287 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  30.87 
 
 
287 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  36.03 
 
 
289 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  34.29 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  35.74 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  31.54 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  32.78 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>