242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1061 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  95.59 
 
 		 295 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  70.51 
 
 		 295 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  66.55 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  54.85 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  54.52 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  54.49 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  53.56 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  52.04 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  48.48 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  48.65 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  47.32 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  47.12 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  46.78 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  49.15 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  47.32 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  45.05 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  47.46 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  47.12 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  45.92 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  48.14 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  48.31 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  44.9 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  44.75 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  45.85 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  43.96 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  45.79 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  44.41 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  43.37 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  41.97 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  43.23 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  41.28 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  39.46 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  39.46 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  39.8 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  39.12 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  37.84 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  39.26 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  38.78 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  39 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  34.92 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  37.46 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  33.9 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  38.13 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  38.13 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  36.39 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.39 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  35.25 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  34.34 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  36.39 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  34.69 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  32.54 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  35 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  35 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  35 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  35.67 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  35.81 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  35 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  36.67 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.11 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  34.92 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  35.37 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.95 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  35.35 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  36.24 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  36.24 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  34.12 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  34.01 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>