242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1912 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  41.3 
 
 
292 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  36.73 
 
 
292 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  38.1 
 
 
292 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  39.25 
 
 
291 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  37.41 
 
 
292 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  37.07 
 
 
291 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  39.26 
 
 
292 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  35.25 
 
 
294 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  38.72 
 
 
292 aa  185  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  34.69 
 
 
293 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  36.95 
 
 
293 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  36.18 
 
 
292 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  38.72 
 
 
293 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  38.57 
 
 
291 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  38.31 
 
 
292 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  37.79 
 
 
292 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  38.23 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  35.49 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  32.76 
 
 
291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  35.25 
 
 
292 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  34.47 
 
 
292 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  35.64 
 
 
289 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  32.42 
 
 
291 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  35.59 
 
 
292 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  35.12 
 
 
295 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  33.45 
 
 
291 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  33.78 
 
 
294 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  31.74 
 
 
290 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  36.18 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  32.65 
 
 
287 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  34.11 
 
 
293 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  35.45 
 
 
289 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  32.99 
 
 
293 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33.67 
 
 
296 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  32.09 
 
 
295 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  32.88 
 
 
295 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  30.95 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  36.61 
 
 
291 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  32.66 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  32.66 
 
 
288 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  31.86 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  31.86 
 
 
287 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  31.92 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  31.53 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.53 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  32.43 
 
 
287 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  34.15 
 
 
326 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  32.09 
 
 
287 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  34.45 
 
 
287 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  35.67 
 
 
290 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  32.11 
 
 
287 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  31.42 
 
 
287 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  31.53 
 
 
300 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  32.54 
 
 
285 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  33.12 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  32.08 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  34.69 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  32.88 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  33.11 
 
 
295 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  33.45 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  34.11 
 
 
293 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  30.27 
 
 
291 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  32.11 
 
 
287 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  34.23 
 
 
287 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  29.55 
 
 
291 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  31.19 
 
 
292 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  31.63 
 
 
288 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  30.85 
 
 
288 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  33.22 
 
 
288 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33 
 
 
287 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  29.25 
 
 
289 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  33.11 
 
 
299 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>