242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3026 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  50.85 
 
 
287 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  52.58 
 
 
288 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  50.85 
 
 
287 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  46.39 
 
 
288 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  50.34 
 
 
287 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  48.3 
 
 
288 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  49.31 
 
 
287 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  48.97 
 
 
287 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  45.33 
 
 
309 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  46.71 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  46.02 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  46.71 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  46.37 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  45.33 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  47.06 
 
 
287 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  44.22 
 
 
300 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  46.02 
 
 
287 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  44.64 
 
 
287 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  44.98 
 
 
287 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  43.94 
 
 
288 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  43.99 
 
 
287 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  43.54 
 
 
300 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  46.37 
 
 
287 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  43.64 
 
 
287 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  43.64 
 
 
287 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  44.83 
 
 
287 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  44.86 
 
 
287 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  43.79 
 
 
287 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  43.79 
 
 
287 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  44.48 
 
 
287 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  44.14 
 
 
287 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  43.45 
 
 
287 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  44.79 
 
 
285 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  43.45 
 
 
287 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  43.45 
 
 
287 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  43.45 
 
 
287 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  43.45 
 
 
287 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  44.71 
 
 
287 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  46.96 
 
 
293 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  43.1 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  44.64 
 
 
287 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  41.24 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  40.48 
 
 
290 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  40.41 
 
 
287 aa  218  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  41.38 
 
 
287 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  44.29 
 
 
287 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  44.64 
 
 
287 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  48.62 
 
 
286 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  41.38 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  41.03 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  40.34 
 
 
287 aa  215  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  42.61 
 
 
289 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  40.14 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  46.85 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  46.92 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  39.31 
 
 
287 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  40.54 
 
 
288 aa  206  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  36.73 
 
 
294 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  36.73 
 
 
294 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  39.58 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  38.97 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  37.37 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  37.72 
 
 
288 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  40.75 
 
 
288 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  40.34 
 
 
288 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  39.66 
 
 
295 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  40.34 
 
 
288 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  40.34 
 
 
292 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  42.12 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  38.05 
 
 
293 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  38.78 
 
 
307 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  38.34 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>