242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3269 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  82.62 
 
 
282 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  68.64 
 
 
300 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  67.94 
 
 
300 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  47.04 
 
 
287 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  47.39 
 
 
287 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  50 
 
 
287 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  50 
 
 
287 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  49.48 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  48.08 
 
 
309 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  47.39 
 
 
287 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  49.65 
 
 
288 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  46.34 
 
 
287 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  45.3 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  47.39 
 
 
290 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  45.3 
 
 
287 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  244  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  46.18 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  44.95 
 
 
287 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  44.95 
 
 
287 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  44.6 
 
 
287 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  47.92 
 
 
287 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  47.57 
 
 
287 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  49.13 
 
 
287 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  47.57 
 
 
287 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  45.14 
 
 
288 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  44.95 
 
 
287 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  47.22 
 
 
287 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  47.39 
 
 
287 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  49.13 
 
 
287 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  48.43 
 
 
287 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  47.2 
 
 
285 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  48.08 
 
 
287 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  46.18 
 
 
288 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  48.08 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  45.64 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  48.78 
 
 
287 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  44.44 
 
 
288 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  47.74 
 
 
287 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  44.6 
 
 
287 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  48.61 
 
 
287 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  44.44 
 
 
288 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  48.62 
 
 
289 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  46.42 
 
 
293 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  43.06 
 
 
288 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  44.44 
 
 
288 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  47.39 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  47.4 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  47.4 
 
 
287 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  40.77 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  43.55 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  40.77 
 
 
287 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  40.77 
 
 
287 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  41.52 
 
 
289 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  44.79 
 
 
288 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  39.37 
 
 
287 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  42.01 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  41.72 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  41.18 
 
 
288 aa  199  6e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  43.75 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  39.25 
 
 
288 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  39.25 
 
 
288 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  36.43 
 
 
290 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  37.3 
 
 
311 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  38.7 
 
 
291 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  35.83 
 
 
307 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  35.45 
 
 
294 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  35.45 
 
 
294 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  35.83 
 
 
315 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  36.33 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  36.16 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>