242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0870 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  97.72 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  96.74 
 
 
336 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  96.42 
 
 
327 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  96.42 
 
 
327 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  96.42 
 
 
307 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  93.49 
 
 
307 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  84.69 
 
 
319 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  82.41 
 
 
307 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  82.08 
 
 
315 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  65.06 
 
 
311 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  64.42 
 
 
311 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  64.74 
 
 
311 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  64.74 
 
 
311 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  62.5 
 
 
311 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  43.97 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  43.46 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  45.93 
 
 
288 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  44.95 
 
 
288 aa  241  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  42.95 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  44.27 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  42.63 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  43.37 
 
 
302 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  45.4 
 
 
309 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  43.04 
 
 
302 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  42.39 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  42.36 
 
 
304 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  43.18 
 
 
302 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  41.03 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  43.77 
 
 
307 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  41.9 
 
 
323 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  39.74 
 
 
309 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  36.74 
 
 
287 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  39.09 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  39.74 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  39.74 
 
 
287 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  36.74 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  37.13 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  38.44 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  37.79 
 
 
288 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.55 
 
 
288 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  38.44 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  33.55 
 
 
288 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.53 
 
 
287 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  33.22 
 
 
288 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.96 
 
 
287 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40.58 
 
 
287 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.42 
 
 
287 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  39.29 
 
 
287 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  37.42 
 
 
287 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.5 
 
 
288 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  34.53 
 
 
288 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  39.29 
 
 
287 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  39.29 
 
 
287 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  39.61 
 
 
287 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  35.83 
 
 
287 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  39.29 
 
 
287 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  38.64 
 
 
287 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  38.64 
 
 
287 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  36.16 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  33.88 
 
 
287 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  38.64 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  40.13 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  40.13 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  35.5 
 
 
287 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  35.5 
 
 
287 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  35.5 
 
 
287 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  35.71 
 
 
289 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  35.41 
 
 
287 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  34.85 
 
 
300 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  34.85 
 
 
300 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  36.16 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  36.81 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  33.88 
 
 
287 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  36.81 
 
 
287 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.81 
 
 
288 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  36.81 
 
 
287 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  36.81 
 
 
287 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  36.81 
 
 
287 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  34.85 
 
 
287 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  34.53 
 
 
287 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  36.48 
 
 
287 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  35.5 
 
 
287 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  36.48 
 
 
287 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  36.16 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>