More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0606 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  100 
 
 
338 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  57.45 
 
 
338 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 
380 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  54.49 
 
 
338 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  55.59 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  54.86 
 
 
339 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  58.44 
 
 
338 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  55.21 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  57.7 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  53.41 
 
 
336 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  51.52 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  44.67 
 
 
373 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  52.57 
 
 
274 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.37 
 
 
321 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  43.43 
 
 
351 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41.73 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  39.93 
 
 
329 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.03 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  42.18 
 
 
322 aa  126  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  30.3 
 
 
334 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  29.89 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  37.55 
 
 
340 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  35.74 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  42.19 
 
 
320 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
337 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
342 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
338 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  36.01 
 
 
344 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
362 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  32.26 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  37.77 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
355 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.46 
 
 
491 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.74 
 
 
321 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  28.57 
 
 
326 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.33 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.33 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  31.33 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  32 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.33 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  39.31 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.04 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  29.54 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.99 
 
 
762 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.56 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
380 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  25.87 
 
 
319 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  34.93 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  28.67 
 
 
354 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.9 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
338 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.87 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.97 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  36.96 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  29.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
405 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  27.54 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  30.8 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.79 
 
 
366 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.14 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03055  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  30.14 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.67 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  34.92 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.15 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  33.03 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  27.91 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  29.21 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.85 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0941  glycosyl transferase family 4  30.25 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0344  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.57 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
591 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3243  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.72 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>