More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2476 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
351 aa  690    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.56 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.42 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
380 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  35.22 
 
 
334 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  42.95 
 
 
338 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  35.76 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.8 
 
 
321 aa  180  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  43.89 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  40.45 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  45.17 
 
 
334 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
336 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
338 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  43.37 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  36.75 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  37.36 
 
 
329 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  39.48 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  35.71 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  38.15 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  35.27 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
352 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.11 
 
 
380 aa  123  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.73 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  35.07 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
462 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.02 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
338 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.89 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.79 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
337 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  26.81 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.27 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
338 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
371 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.09 
 
 
360 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
440 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  29.09 
 
 
384 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  31.29 
 
 
404 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.84 
 
 
386 aa  106  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
339 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
333 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  29.62 
 
 
379 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  33.43 
 
 
344 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  25.99 
 
 
354 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  32.98 
 
 
325 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
338 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
325 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
350 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.1 
 
 
359 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
405 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
399 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
399 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
399 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
545 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
495 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
342 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  32.08 
 
 
339 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  27.91 
 
 
351 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
376 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  31.41 
 
 
330 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
338 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  32.13 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.23 
 
 
336 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1331  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.54 
 
 
357 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  30.69 
 
 
449 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
542 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  35.93 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  33.08 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  34.04 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  30.23 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  29.75 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.25 
 
 
391 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.35 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.35 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  29.69 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.57 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  27.69 
 
 
326 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.57 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  28.57 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.73 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.58 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  35.05 
 
 
333 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  28.49 
 
 
387 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
353 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  26.92 
 
 
391 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>