More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1985 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  100 
 
 
339 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  61.19 
 
 
338 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  63.08 
 
 
336 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  59.28 
 
 
338 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  58.7 
 
 
380 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  60.83 
 
 
338 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  59.35 
 
 
336 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  58.13 
 
 
334 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  58.26 
 
 
334 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  57.49 
 
 
336 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  54.61 
 
 
338 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.02 
 
 
373 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 
351 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  47.51 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.01 
 
 
321 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  39.54 
 
 
347 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  39.79 
 
 
329 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.21 
 
 
333 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.31 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  41.2 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37.89 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 
342 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  36.43 
 
 
340 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.58 
 
 
322 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  36.67 
 
 
351 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
338 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.26 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  36.88 
 
 
338 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.47 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 
334 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.56 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  36.36 
 
 
344 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.93 
 
 
386 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
338 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
338 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
338 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
371 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  33.83 
 
 
326 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
357 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
350 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.41 
 
 
353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.81 
 
 
357 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  33.08 
 
 
351 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.86 
 
 
416 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  32.81 
 
 
357 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
376 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.81 
 
 
357 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.41 
 
 
357 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
542 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.57 
 
 
366 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  34.07 
 
 
314 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
357 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  32.1 
 
 
354 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.02 
 
 
357 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
323 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.56 
 
 
315 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30 
 
 
347 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.47 
 
 
357 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.47 
 
 
357 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.16 
 
 
316 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  33.74 
 
 
317 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  31.16 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.07 
 
 
762 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
362 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.01 
 
 
360 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.8 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  31.4 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
357 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.99 
 
 
385 aa  94.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
462 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  31.17 
 
 
391 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
369 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  31.2 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  31.92 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  30.79 
 
 
406 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
521 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
369 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  29.85 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2824  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30.28 
 
 
357 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
495 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>