More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0731 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  100 
 
 		 373 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  47.75 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  51.36 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  49.31 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  48.41 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  46.71 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  49.83 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 		 338 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  44.86 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  48.29 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  48.12 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  44.52 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  40.49 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  37.55 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  43.7 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.56 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.22 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  38.6 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.36 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  31.56 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.07 
 
 		 325 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  34.58 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.15 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  36.24 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.03 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  34.24 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.86 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.03 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  29.73 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  31.29 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  30.21 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  31.65 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  33.21 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.59 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.75 
 
 		 336 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 496 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  32.33 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  32.48 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00705  hypothetical protein  29.47 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  32.88 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.6 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 545 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.6 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  29.96 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.08 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2824  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.62 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.81 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.14 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.48 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.48 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  31.48 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.45 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.6 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  30.89 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.21 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.63 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  30.67 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.45 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.61 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  32.06 
 
 		 343 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.04 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.21 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  31.8 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.21 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001775  undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  27.04 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.21 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 521 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1332  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.6 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.157987  decreased coverage  0.000128778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1397  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.6 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>