More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1872 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  100 
 
 
320 aa  610  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
352 aa  242  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  51.01 
 
 
338 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  52.74 
 
 
338 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  52.74 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  47.64 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  52.05 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  52.4 
 
 
338 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  51.71 
 
 
338 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  49.15 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  50.68 
 
 
350 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  49.83 
 
 
336 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  48.14 
 
 
343 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.22 
 
 
337 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  41.5 
 
 
351 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  43.93 
 
 
347 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.24 
 
 
373 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.55 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  42.69 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  29.38 
 
 
334 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  43.07 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.21 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
334 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 
336 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.89 
 
 
366 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.83 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.24 
 
 
359 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  39.33 
 
 
334 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  34.41 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  29.6 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  37.8 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  31.35 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
355 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.36 
 
 
360 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  29.9 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.71 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
545 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.05 
 
 
380 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  29.89 
 
 
394 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  38.24 
 
 
326 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
495 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
348 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.72 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  39.02 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
357 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.71 
 
 
357 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  29.71 
 
 
357 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.71 
 
 
357 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  28 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.71 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
360 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
337 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.35 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.35 
 
 
357 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
339 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.35 
 
 
357 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  36.21 
 
 
339 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
349 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  30.35 
 
 
317 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.11 
 
 
354 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
361 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
334 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.42 
 
 
274 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  32.61 
 
 
340 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.56 
 
 
491 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  27.81 
 
 
370 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  34.72 
 
 
348 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  32.61 
 
 
320 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  28.52 
 
 
312 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.17 
 
 
386 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  29.12 
 
 
354 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  34.56 
 
 
322 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  31.41 
 
 
357 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
372 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.98 
 
 
325 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.48 
 
 
551 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
343 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  38.13 
 
 
333 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>