More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1413 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 334 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  78.14 
 
 		 334 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  67.07 
 
 		 380 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  67.57 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  69.04 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  68.67 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  64.86 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  63.33 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  61.8 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  58.13 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  55.41 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  50.52 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  49.82 
 
 		 274 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.84 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  42.22 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  40.53 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  41.95 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.58 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.95 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.73 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.29 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  40.3 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  35.66 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.61 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.45 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  33 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.72 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  30.25 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  29.52 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  36.57 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.23 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  29.09 
 
 		 354 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  34.06 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.57 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  35.31 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.94 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.94 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  28.42 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  34.62 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  36.8 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.85 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.33 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  34.21 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.56 
 
 		 551 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.67 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 495 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  36.11 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  26.59 
 
 		 762 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  34.14 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  26.96 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  38.78 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  34.6 
 
 		 340 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 440 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  30.94 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.05 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.67 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.71 
 
 		 441 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 462 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.04 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  31.02 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  30.49 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  27.88 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.29 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.29 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>