More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1305 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
440 aa  850    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  54.04 
 
 
462 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  38.26 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18590  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  51.01 
 
 
266 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0164953  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.45 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  32.66 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.27 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.27 
 
 
334 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  34.48 
 
 
338 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.94 
 
 
373 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  35.37 
 
 
339 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  35.05 
 
 
351 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.03 
 
 
366 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37.59 
 
 
325 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.02 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
336 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  35.25 
 
 
347 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
325 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
338 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
334 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
336 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
376 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  35 
 
 
326 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  38.83 
 
 
333 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
353 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
333 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.01 
 
 
360 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  32.19 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
361 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  29.3 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
357 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  26.64 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.53 
 
 
354 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
333 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  32.82 
 
 
340 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0035  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
334 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  29.68 
 
 
357 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
334 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.24 
 
 
316 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.09 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  31.23 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
336 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  31.94 
 
 
344 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.14 
 
 
762 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.41 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
357 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.52 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  28.52 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
357 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
352 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.52 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  32.63 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.15 
 
 
403 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
337 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
380 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.52 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.86 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
399 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
399 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
399 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.18 
 
 
357 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  26.06 
 
 
354 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.47 
 
 
315 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  33 
 
 
320 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  28.61 
 
 
394 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  30.57 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  29.22 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.03 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  29.03 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  31.41 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  27.46 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  30.16 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0941  glycosyl transferase family 4  27.24 
 
 
297 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  26.09 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  24.27 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.42 
 
 
274 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.16 
 
 
491 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.26 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  29.87 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  34.69 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  27.74 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  25.77 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.26 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>