More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0249 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  100 
 
 
344 aa  658    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 
362 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  37.27 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  37.12 
 
 
329 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
334 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.07 
 
 
373 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
351 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  32.72 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  37.07 
 
 
339 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  37.19 
 
 
326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  36.36 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
351 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
351 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.85 
 
 
380 aa  112  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  33.82 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  36.33 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
336 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.96 
 
 
359 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.18 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  30.64 
 
 
347 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  30.8 
 
 
334 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
352 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  30.6 
 
 
351 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
375 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.68 
 
 
354 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  28.38 
 
 
354 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
338 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.78 
 
 
360 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
334 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.02 
 
 
762 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  30.21 
 
 
317 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  31.94 
 
 
404 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.04 
 
 
336 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  29.59 
 
 
312 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  32.38 
 
 
340 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
338 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
399 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
399 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
399 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
521 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.33 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  32.41 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.33 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.33 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  28.73 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
357 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0580  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.52 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  27.52 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.52 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  27.89 
 
 
330 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  34.19 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  39.15 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.44 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
405 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.82 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  35.04 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  30.63 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.05 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  29.38 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.3 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  33.07 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.99 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  44.44 
 
 
274 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  26.98 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  29.52 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0121  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.93 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.91 
 
 
407 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  33.03 
 
 
389 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  36.5 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
545 aa  89.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  29.04 
 
 
399 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.99 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.9 
 
 
403 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
339 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  26.09 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.28 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  26.58 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  29.76 
 
 
437 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>