More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1378 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 336 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  64.29 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  67.86 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  68.07 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  65.77 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  61.61 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  65.06 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  64.58 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  66.17 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  61.86 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  55.26 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  48.61 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  51.79 
 
 		 274 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.49 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  40.85 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41.98 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  37.54 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.85 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.85 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.41 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37.81 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  41.8 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  36.59 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.15 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.64 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.2 
 
 		 491 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  32.21 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 542 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  35.52 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  35.44 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.1 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  29.3 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.96 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 496 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  32.41 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.33 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  34.36 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.34 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.1 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 495 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.73 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.1 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  31.39 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.51 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.81 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  36.84 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.81 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.53 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  30.53 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3243  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  32.2 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.53 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  30.88 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  27.14 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  36.12 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2091  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  29.41 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.90177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  30.47 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.52 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.92 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.92 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.92 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.33 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.56 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.56 
 
 		 357 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 462 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  36.24 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.97 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.8 
 
 		 551 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  28.03 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.24 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>