More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3267 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  100 
 
 
326 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
334 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.59 
 
 
373 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.51 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  40.23 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  33.21 
 
 
320 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41 
 
 
347 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  36.77 
 
 
344 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
323 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
342 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  37.98 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  35.86 
 
 
329 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4067  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase-like protein  34.56 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
336 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
334 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  34.3 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  39.17 
 
 
320 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
352 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  35.07 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
336 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.15 
 
 
316 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.52 
 
 
315 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
338 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  36.39 
 
 
322 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
351 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  34.82 
 
 
334 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.01 
 
 
334 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.01 
 
 
333 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
338 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.85 
 
 
338 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
338 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
338 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
338 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18590  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  36.48 
 
 
266 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0164953  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.16 
 
 
336 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.08 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  26.25 
 
 
354 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  29.37 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  28.33 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  32.06 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
339 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  36.26 
 
 
343 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  34.55 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
462 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
542 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
333 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.49 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  32.69 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  25.44 
 
 
328 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.8 
 
 
366 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
399 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
495 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  30.56 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  37.04 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
399 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
399 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  31.42 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  38.68 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.71 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
405 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  28.25 
 
 
379 aa  89.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  30.03 
 
 
404 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
591 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.1 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.25 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14271  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.74 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
371 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3144  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.79 
 
 
366 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314399  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.48 
 
 
427 aa  87  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  28.47 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0344  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  28.67 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0121  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
545 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.8 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0123  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.299321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  32.27 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  30.83 
 
 
367 aa  84  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>