More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2161 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
462 aa  871    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  54.83 
 
 
440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
351 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  38.32 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.67 
 
 
321 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18590  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  51.33 
 
 
266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0164953  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
339 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  34.5 
 
 
351 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  38.26 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  40.15 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
380 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.33 
 
 
373 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  33.22 
 
 
349 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  32.89 
 
 
347 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  39.21 
 
 
333 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.49 
 
 
366 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.73 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  32.41 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37.77 
 
 
325 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
371 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  34.42 
 
 
339 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  34.72 
 
 
326 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
325 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  32.16 
 
 
349 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
495 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
348 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
337 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
361 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  34.21 
 
 
338 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
310 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
338 aa  107  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  29.37 
 
 
334 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  27.15 
 
 
354 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  41.02 
 
 
333 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37 
 
 
322 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  28.77 
 
 
333 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.84 
 
 
762 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  32.76 
 
 
340 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.77 
 
 
360 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
336 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.81 
 
 
386 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.89 
 
 
385 aa  100  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
496 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.27 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32 
 
 
321 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
405 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.63 
 
 
354 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  32.32 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.81 
 
 
380 aa  96.7  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  28.12 
 
 
317 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4067  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase-like protein  31.62 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
372 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
334 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  34.3 
 
 
344 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  33.66 
 
 
334 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  32.16 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.83 
 
 
359 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  28.82 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  25.38 
 
 
441 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  27.36 
 
 
312 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
352 aa  91.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.73 
 
 
316 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  23.61 
 
 
329 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
357 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
323 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  27.5 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  29.63 
 
 
351 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  27.5 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
521 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
349 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
405 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3910  glycosyl transferase family 4  29.39 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.993379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.79 
 
 
405 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  26.9 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
357 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  25.92 
 
 
384 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
380 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.13 
 
 
375 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  29.63 
 
 
348 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0344  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
305 aa  87  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  29.65 
 
 
394 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
369 aa  86.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.68 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.96 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>