More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0401 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  100 
 
 
491 aa  979    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  40.59 
 
 
521 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  41.16 
 
 
366 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
353 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  35.56 
 
 
762 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
371 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
376 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  37.54 
 
 
351 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
349 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  39.87 
 
 
312 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
361 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  39.8 
 
 
360 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.94 
 
 
353 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
357 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 
357 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.39 
 
 
357 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.87 
 
 
357 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.7 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  37.74 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  38.7 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.7 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  37.27 
 
 
354 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  38.12 
 
 
554 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.78 
 
 
357 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
351 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
351 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  40.79 
 
 
349 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 
348 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.73 
 
 
357 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  33.74 
 
 
326 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
357 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  41.31 
 
 
354 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  36.89 
 
 
385 aa  176  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  38.94 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  34.44 
 
 
360 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
372 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.97 
 
 
441 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
369 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.66 
 
 
391 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.98 
 
 
380 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  36.73 
 
 
406 aa  170  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.43 
 
 
386 aa  169  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
355 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.51 
 
 
319 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  36.73 
 
 
349 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  36.79 
 
 
348 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  32.51 
 
 
319 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.5 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  37.46 
 
 
317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
542 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.07 
 
 
359 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
360 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
333 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  36.18 
 
 
437 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  36.72 
 
 
360 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  35 
 
 
340 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.99 
 
 
600 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  36.92 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35 
 
 
405 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.98 
 
 
387 aa  156  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  32.92 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  38.53 
 
 
364 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  38.53 
 
 
364 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
380 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
545 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  35.38 
 
 
375 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.91 
 
 
370 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  37.61 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  34.42 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  33.52 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
591 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.08 
 
 
329 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  30.59 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  33.78 
 
 
382 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  35.85 
 
 
425 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.72 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
369 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  34.92 
 
 
352 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
369 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  32.33 
 
 
330 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2090  putative glycosyltransferase  39.37 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1295  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.025134  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  33.01 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  31.15 
 
 
393 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.11 
 
 
403 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  33.22 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
375 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.04 
 
 
416 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.54 
 
 
551 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.79 
 
 
407 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  36.6 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  38.17 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1754  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
394 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>