More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4053 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
336 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  64.26 
 
 
338 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  59.45 
 
 
380 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  62.5 
 
 
336 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  59.1 
 
 
338 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  61.8 
 
 
334 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  57.06 
 
 
339 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  59.4 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  61.83 
 
 
334 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  62.58 
 
 
338 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  51.75 
 
 
338 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  46.88 
 
 
373 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
351 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  50 
 
 
274 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.67 
 
 
321 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  39.52 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  42.6 
 
 
347 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  40.73 
 
 
329 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  30.91 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.97 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
333 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  41.11 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  37.45 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.13 
 
 
491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.35 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.38 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.2 
 
 
336 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
333 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  37.58 
 
 
339 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.83 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
542 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
339 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.41 
 
 
416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  36.16 
 
 
344 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  30.65 
 
 
317 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  33.8 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  35.69 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  31.48 
 
 
351 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
495 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.38 
 
 
366 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
362 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  26.83 
 
 
354 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
350 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  35.19 
 
 
343 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.48 
 
 
315 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
496 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.05 
 
 
380 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
349 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.29 
 
 
403 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.17 
 
 
762 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
335 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  30.87 
 
 
391 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.69 
 
 
316 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.53 
 
 
385 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
361 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  30.12 
 
 
328 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.5 
 
 
340 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  29.12 
 
 
326 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.02 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.83 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.83 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.33 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.83 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.2 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.68 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
462 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.86 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
545 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
440 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  35.34 
 
 
387 aa  95.9  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  26.58 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  31.5 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  27.54 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.58 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
343 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>