More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3657 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
337 aa  633  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
339 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.29 
 
 
321 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  43.34 
 
 
338 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.93 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  49.27 
 
 
333 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
338 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
380 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  41.89 
 
 
339 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.43 
 
 
338 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  42.95 
 
 
334 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
333 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
342 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
351 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  44.57 
 
 
339 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  41.43 
 
 
340 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
336 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  38.1 
 
 
347 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.01 
 
 
334 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  50.19 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  35.89 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.27 
 
 
333 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0035  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  39.8 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  41.85 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4505  glycosyl transferase family 4  44.53 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  40.94 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
338 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  45.85 
 
 
341 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  40.42 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
338 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
495 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  38.27 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.39 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.45 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.38 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.95 
 
 
274 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
334 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
462 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.09 
 
 
387 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.09 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  30.36 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  31.21 
 
 
317 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  36.62 
 
 
325 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
335 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
351 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
351 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  36.4 
 
 
326 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
325 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
440 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  33.83 
 
 
329 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
496 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  29.57 
 
 
328 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.87 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3091  glycosyl transferase family protein  42.09 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  37.78 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  27.14 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.43 
 
 
491 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18590  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  43.23 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0164953  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.56 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  28.11 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  37.16 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  26.9 
 
 
384 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.47 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.67 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  29.71 
 
 
367 aa  89.4  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.1 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.03 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.03 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  31.8 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>