More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3091 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3091  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
327 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  41.53 
 
 
351 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  37.33 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.65 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41.04 
 
 
347 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  36.53 
 
 
338 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  38.41 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.77 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  31.42 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
353 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
355 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  39.92 
 
 
320 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  36.69 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.15 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
334 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  31.53 
 
 
317 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
338 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  34.27 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.6 
 
 
375 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  30.43 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
336 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
338 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
338 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.57 
 
 
360 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  32.18 
 
 
351 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
376 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
462 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
337 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
495 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.65 
 
 
600 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  35.57 
 
 
326 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.96 
 
 
491 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
338 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
542 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.72 
 
 
336 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
305 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
350 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  28.57 
 
 
319 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.57 
 
 
319 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
351 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
333 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
351 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 
334 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.71 
 
 
403 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  27.49 
 
 
326 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
362 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
496 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
349 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
336 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18590  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  46.98 
 
 
266 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0164953  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  31.32 
 
 
399 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  26.45 
 
 
354 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
371 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.93 
 
 
321 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.42 
 
 
315 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  28.11 
 
 
333 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  35.81 
 
 
340 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
521 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.08 
 
 
405 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  33.33 
 
 
330 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  33.75 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  25.55 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  32.93 
 
 
343 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  31.83 
 
 
399 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0344  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.58 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.64 
 
 
416 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.28 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  32.73 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.21 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  31.08 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.95 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
545 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  31.85 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.92 
 
 
337 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.92 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.62 
 
 
762 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3910  glycosyl transferase family 4  31.76 
 
 
367 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.993379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  31.67 
 
 
353 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  30.14 
 
 
406 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.92 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>