More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0775 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
338 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  89.27 
 
 
338 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  88.46 
 
 
338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  86.69 
 
 
350 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  89.27 
 
 
338 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  88.96 
 
 
338 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  80.47 
 
 
338 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  69.03 
 
 
340 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  70.06 
 
 
342 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  67.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  65.25 
 
 
336 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  62.31 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  62.31 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  62.31 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  62.31 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  62.31 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  62.31 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  61.99 
 
 
337 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 
352 aa  248  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  52.4 
 
 
320 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  40.19 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.86 
 
 
338 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  38.43 
 
 
347 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.68 
 
 
373 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  38.78 
 
 
339 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  28.14 
 
 
334 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  28.18 
 
 
333 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  30.77 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  37.72 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
351 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
351 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
380 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  37.83 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  39.64 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
334 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  34.58 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
325 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
380 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
336 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
361 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.89 
 
 
357 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  27.89 
 
 
357 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.89 
 
 
357 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.4 
 
 
357 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  28.27 
 
 
354 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.77 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
357 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.28 
 
 
321 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.4 
 
 
357 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  28.42 
 
 
312 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
333 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
357 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  28.62 
 
 
394 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  32.04 
 
 
329 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.15 
 
 
315 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.4 
 
 
407 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
353 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
335 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.66 
 
 
357 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.66 
 
 
357 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
339 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
542 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.12 
 
 
322 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  36.82 
 
 
333 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.41 
 
 
359 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
405 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  29.97 
 
 
351 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.73 
 
 
380 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
361 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
399 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.34 
 
 
335 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  30.67 
 
 
404 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
545 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
399 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  28.09 
 
 
393 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
399 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.03 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  27.61 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  28.94 
 
 
399 aa  97.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
369 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  31.9 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.78 
 
 
427 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
495 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  26.69 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
496 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2170  glycosyl transferase family 4  28.67 
 
 
375 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.89 
 
 
316 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  31.06 
 
 
762 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  30.55 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>