More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3937 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 380 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  65.02 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  67.07 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  60.71 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  62.57 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  66.17 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  65.48 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  60.96 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  58.16 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  59.45 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  56.09 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  47.92 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.11 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  50 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41.22 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  38.06 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  38.46 
 
 		 329 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.46 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 325 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.71 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.71 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.44 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  39.53 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  34.22 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.53 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.6 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  33.94 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 495 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  28.78 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.63 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 338 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  32.11 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.31 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 496 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  36.2 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  27.88 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  32.8 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  33.58 
 
 		 339 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 338 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  33.46 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 462 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.68 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  36.82 
 
 		 343 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.56 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  31.38 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.89 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03055  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  26.73 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3091  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3243  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.89 
 
 		 354 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  29.75 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  29.41 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 		 762 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 542 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 323 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  24.57 
 
 		 319 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.18 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.18 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  24.57 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  35.38 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.77 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  30.97 
 
 		 314 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  31.12 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  25.4 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.52 
 
 		 403 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  28.62 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 361 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.17 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  32.02 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0795  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.46 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  25.17 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2091  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  26.64 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.90177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  29.27 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>