More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1804 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  100 
 
 		 334 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  78.14 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  66.17 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  65.33 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  66.25 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  63.03 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  68.36 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  60.9 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  57.83 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  61.83 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  57.91 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  48.1 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  52.38 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  45.39 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  40.07 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  41.51 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.97 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.21 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  37.88 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.58 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  40.88 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  38.38 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.56 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.76 
 
 		 491 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.69 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.67 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 542 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.52 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  29.27 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  34.08 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  35.36 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.51 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  35.66 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0901  glycosyl transferase family 4  36.7 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.87 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.74 
 
 		 551 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.9 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  27.85 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 362 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  32.26 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.87 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  32.9 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.85 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  27.97 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.81 
 
 		 391 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.98 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  30.59 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.14 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 335 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.83 
 
 		 403 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  29.67 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  26.62 
 
 		 326 aa  92.4  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  29.33 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  36.43 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  27.02 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.25 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  27.7 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.52 
 
 		 762 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  36.57 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 545 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 495 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  34.31 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  26.3 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.91 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.16 
 
 		 441 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  29.49 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.3 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3925  glycosyl transferase family 4  34.47 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>